Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms