Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPUSD1Q9UJJ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms