Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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