Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms