Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms