Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms