Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP1Q9NZI2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP1Q9NZI2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms