Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms