Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms