Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms