Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC4Q9NTJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms