Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms