Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms