Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMSN1Q9NSI8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMSN1Q9NSI8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms