Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms