Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT82Q9NSB4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT82Q9NSB4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms