Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPRSS4Q9NRS4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms