Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLE3Q9NRF9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLE3Q9NRF9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms