Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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