Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms