Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms