Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms