Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3GQ9HC16 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms