Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms