Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP3Q9H4L4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms