Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3Q9H3W5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3Q9H3W5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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