Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms