Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms