Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP1Q9C000 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms