Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
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