Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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