Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCGF6Q9BYE7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCGF6Q9BYE7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms