Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms