Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRTQ9BXP5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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