Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PLVAPQ9BX97 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLVAPQ9BX97 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms