Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms