Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBDC1Q9BVG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms