Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
NDFIP1Q9BT67 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDFIP1Q9BT67 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDFIP1Q9BT67 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDFIP1Q9BT67 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDFIP1Q9BT67 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms