Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED2Q99967 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CITED2Q99967 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CITED2Q99967 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms