Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP1Q99575 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP1Q99575 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms