Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5RAP2Q96SN8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms