Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms