Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms