Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRIG1Q96JA1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms