Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms