Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED3Q96IU2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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