Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms