Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms