Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms