Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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GTF3C6Q969F1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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GTF3C6Q969F1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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GTF3C6Q969F1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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GTF3C6Q969F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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GTF3C6Q969F1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6Q969F1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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